Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPCN1Q9ULQ1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms