Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA2Q9UL42 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms