Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMFRQ9UKV5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms