Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms