Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FOXD3Q9UJU5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms