Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms