Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms