Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELL3Q9HB65 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms