Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms