Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J8

WDR33, pre-mRNA 3' end processing protein WDR33, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR33Q9C0J8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR33Q9C0J8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
WDR33Q9C0J8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR33Q9C0J8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR33Q9C0J8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR33Q9C0J8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR33Q9C0J8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR33Q9C0J8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR33Q9C0J8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR33Q9C0J8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms