Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSER1Q9C0I3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
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