Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC94Q9BW85 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms