Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHCHD7Q9BUK0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms