Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms