Protein–RNA interactions for Protein: Q96LP6

C12orf42, Uncharacterized protein C12orf42, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf42Q96LP6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf42Q96LP6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms