Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms