Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E3Q969T4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms