Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD50Q92878 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms