Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CMTM1Q8IZ96 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CMTM1Q8IZ96 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CMTM1Q8IZ96 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CMTM1Q8IZ96 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CMTM1Q8IZ96 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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