Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC73Q6ZRK6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms