Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRSAM1Q6UWE0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms