Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms