Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms