Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF40BQ6NWY9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms