Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms