Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms