Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
AGAP6Q5VW22 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AGAP6Q5VW22 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AGAP6Q5VW22 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AGAP6Q5VW22 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AGAP6Q5VW22 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AGAP6Q5VW22 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AGAP6Q5VW22 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AGAP6Q5VW22 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AGAP6Q5VW22 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AGAP6Q5VW22 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AGAP6Q5VW22 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AGAP6Q5VW22 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AGAP6Q5VW22 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AGAP6Q5VW22 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AGAP6Q5VW22 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AGAP6Q5VW22 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AGAP6Q5VW22 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AGAP6Q5VW22 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
AGAP6Q5VW22 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
AGAP6Q5VW22 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AGAP6Q5VW22 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms