Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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TMEM78Q5T7P6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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TMEM78Q5T7P6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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TMEM78Q5T7P6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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TMEM78Q5T7P6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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TMEM78Q5T7P6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM78Q5T7P6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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TMEM78Q5T7P6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM78Q5T7P6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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TMEM78Q5T7P6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM78Q5T7P6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TMEM78Q5T7P6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM78Q5T7P6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM78Q5T7P6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM78Q5T7P6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM78Q5T7P6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM78Q5T7P6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM78Q5T7P6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM78Q5T7P6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM78Q5T7P6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM78Q5T7P6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM78Q5T7P6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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