Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms