Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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