Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms