Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 NOVA1-209ENST00000547619 947 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXD1Q16676 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
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