Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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TNXAQ16473 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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