Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 KDM2A-203ENST00000517637 463 ntTSL 38.96□□□□□ -0.981e-8■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 KDM2A-205ENST00000525041 697 ntTSL 47.59□□□□□ -1.191e-8■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 EIF4A1-228ENST00000583389 951 ntTSL 313.18□□□□□ -0.39e-11■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 EIF4A1-221ENST00000581841 621 ntTSL 28.88□□□□□ -0.991e-10■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 NCAPG2-208ENST00000474940 583 ntTSL 412.02□□□□□ -0.496e-7■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 CLCN7-209ENST00000565092 2740 ntTSL 215.51■□□□□ 0.074e-9■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 CDC37-208ENST00000590632 601 ntTSL 216.47■□□□□ 0.232e-12■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 CDC37-205ENST00000589625 587 ntTSL 213.86□□□□□ -0.192e-12■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 AP2M1-222ENST00000621863 1305 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.926e-7■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 MRPS15-204ENST00000488606 2127 ntTSL 27.65□□□□□ -1.186e-9■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.051e-7■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 CDC25C-202ENST00000348983 1951 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.561e-7■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 CDC25C-209ENST00000514555 1332 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.831e-7■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 CDC25C-201ENST00000323760 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.111e-7■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 CDC25C-203ENST00000415130 1556 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.211e-7■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.721e-8■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 PILRB-204ENST00000438028 1822 ntTSL 1 (best)17.31■□□□□ 0.361e-8■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 PILRB-210ENST00000457519 2074 ntTSL 1 (best)17.21■□□□□ 0.351e-8■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 PILRB-206ENST00000443526 1364 ntTSL 1 (best)16.73■□□□□ 0.271e-8■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.261e-8■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 PILRB-202ENST00000422808 1599 ntTSL 1 (best)16.48■□□□□ 0.231e-8■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 PILRB-201ENST00000419749 1506 ntTSL 1 (best)15.78■□□□□ 0.121e-8■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 PILRB-211ENST00000493091 4345 ntTSL 212.47□□□□□ -0.411e-8■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 DENND5A-202ENST00000524446 566 ntTSL 44.95□□□□□ -1.623e-10■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 MVD-202ENST00000561895 499 ntTSL 211.5□□□□□ -0.571e-12■■■■■ 32.2
SF3B4Q15427 ARRB1-211ENST00000533255 551 ntTSL 210.03□□□□□ -0.85e-7■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.151e-7■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 CLASRP-205ENST00000585432 290 ntTSL 215.54■□□□□ 0.086e-8■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 TFRC-210ENST00000465288 560 ntTSL 57.89□□□□□ -1.152e-17■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.577e-34■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 PI4KAP2-206ENST00000470274 2414 ntTSL 217.29■□□□□ 0.367e-34■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 PI4KAP2-203ENST00000462560 2553 ntTSL 1 (best)14.61□□□□□ -0.077e-34■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 PI4KAP2-213ENST00000494740 2273 ntTSL 514.61□□□□□ -0.077e-34■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 PI4KAP2-204ENST00000463608 2816 ntTSL 514.32□□□□□ -0.127e-34■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 PI4KAP2-208ENST00000477296 1787 ntTSL 214.03□□□□□ -0.167e-34■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.297e-34■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC12.66□□□□□ -0.387e-34■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 PDIA5-207ENST00000489923 1651 ntTSL 1 (best)19.94■□□□□ 0.783e-7■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.333e-7■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 GNAS-232ENST00000476196 1839 ntTSL 29.94□□□□□ -0.821e-7■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 GNAS-255ENST00000496934 2837 ntTSL 26.79□□□□□ -1.321e-7■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 FRRS1-203ENST00000489209 216 ntTSL 53.6□□□□□ -1.833e-10■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.734e-7■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 MELTF-AS1-203ENST00000424769 356 ntTSL 27.73□□□□□ -1.174e-7■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 AHCY-203ENST00000473516 488 ntTSL 311.58□□□□□ -0.563e-11■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 PPP6R3-204ENST00000393801 5069 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.655e-7■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 PPP6R3-203ENST00000393800 5093 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.765e-7■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 PPP6R3-201ENST00000265636 4794 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.825e-7■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 PPP6R3-226ENST00000534534 2968 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.845e-7■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 PPP6R3-202ENST00000265637 4783 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.865e-7■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 PPP6R3-205ENST00000524845 2771 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.895e-7■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 PPP6R3-214ENST00000527403 4862 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.955e-7■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 PPP6R3-218ENST00000529710 3228 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.055e-7■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.165e-7■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.522e-7■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 PLCD1-203ENST00000461445 3271 ntTSL 214.03□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 32.1
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SF3B4Q15427 MARS-229ENST00000552499 555 ntTSL 34.35□□□□□ -1.712e-6■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.175e-9■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 MRPS15-202ENST00000462067 1612 ntTSL 29.43□□□□□ -0.95e-9■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 ARHGEF11-201ENST00000361409 5788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 ARHGEF11-206ENST00000487682 4796 ntTSL 29.61□□□□□ -0.872e-7■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 ARHGEF11-202ENST00000368194 6889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.932e-7■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 ACTR3-206ENST00000484165 676 ntTSL 24.52□□□□□ -1.692e-7■■■■■ 32.1
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SF3B4Q15427 RPS11-203ENST00000596873 583 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.346e-30■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 SKIV2L-207ENST00000471818 706 ntTSL 514.74□□□□□ -0.059e-15■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 SKIV2L-209ENST00000483553 1307 ntTSL 514.3□□□□□ -0.127e-15■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 TRIP10-209ENST00000598843 469 ntTSL 212.26□□□□□ -0.455e-8■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 TOP1MT-206ENST00000518951 1461 ntTSL 518.76■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 TOP1MT-207ENST00000519139 1561 ntTSL 516.75■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 TOP1MT-209ENST00000519591 1007 ntTSL 513.23□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 TOP1MT-217ENST00000523417 698 ntTSL 311.6□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 TOP1MT-204ENST00000518007 509 ntTSL 59.68□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 TOP1MT-214ENST00000522041 906 ntTSL 39.32□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 KMT2B-204ENST00000592092 823 ntTSL 216.1■□□□□ 0.178e-7■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 ATXN2L-214ENST00000564284 603 ntTSL 214.54□□□□□ -0.082e-16■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 HACD2-202ENST00000469317 590 ntTSL 313.59□□□□□ -0.239e-9■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.359e-9■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 HACD2-204ENST00000480081 574 ntTSL 410.59□□□□□ -0.719e-9■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 TMBIM1-207ENST00000429501 677 ntTSL 511.34□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 TMBIM1-220ENST00000466012 572 ntTSL 511.28□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 TMBIM1-223ENST00000495113 596 ntTSL 210.71□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 TMBIM1-206ENST00000425694 569 ntTSL 210.71□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 TMBIM1-204ENST00000418569 589 ntTSL 39.82□□□□□ -0.842e-7■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 SETD5-218ENST00000466826 284 ntTSL 22.04□□□□□ -2.082e-46■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 FAM118A-208ENST00000462361 712 ntTSL 211.05□□□□□ -0.644e-12■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 FAM118A-214ENST00000483102 657 ntTSL 27.62□□□□□ -1.194e-12■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 LAP3-202ENST00000503467 1709 ntTSL 28.34□□□□□ -1.072e-8■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 LAP3-209ENST00000513105 626 ntTSL 36.38□□□□□ -1.392e-8■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 LAP3-203ENST00000504614 813 ntTSL 35.02□□□□□ -1.612e-8■■■■■ 32.1
SF3B4Q15427 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.123e-7■■■■■ 32
SF3B4Q15427 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.123e-7■■■■■ 32
SF3B4Q15427 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.183e-7■■■■■ 32
SF3B4Q15427 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.193e-7■■■■■ 32
SF3B4Q15427 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.293e-7■■■■■ 32
SF3B4Q15427 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.293e-7■■■■■ 32
SF3B4Q15427 RAF1-209ENST00000475353 599 ntTSL 49.6□□□□□ -0.877e-16■■■■■ 32
SF3B4Q15427 RAF1-207ENST00000465826 1518 ntTSL 39.58□□□□□ -0.887e-16■■■■■ 32
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