Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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PRKD1Q15139 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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PRKD1Q15139 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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PRKD1Q15139 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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PRKD1Q15139 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRKD1Q15139 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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