Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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HERPUD1Q15011 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERPUD1Q15011 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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