Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
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