Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PDE6HQ13956 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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PDE6HQ13956 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PDE6HQ13956 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PDE6HQ13956 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PDE6HQ13956 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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PDE6HQ13956 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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PDE6HQ13956 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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PDE6HQ13956 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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