Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms