Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
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