Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 SDF4-207ENST00000494748 3516 ntTSL 216.58■□□□□ 0.247e-7■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 JPT2-202ENST00000382710 962 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.123e-6■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.042e-6■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -02e-6■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.987e-7■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.917e-7■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.797e-7■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 NDUFB2-210ENST00000475276 539 ntTSL 4 BASIC9.11□□□□□ -0.957e-7■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 NDUFB2-214ENST00000479181 665 ntTSL 27.98□□□□□ -1.137e-7■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.547e-7■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 DCXR-206ENST00000578273 877 ntTSL 525.66■■□□□ 1.74e-11■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 DCXR-218ENST00000582900 676 ntTSL 324.26■■□□□ 1.474e-11■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 DCXR-215ENST00000581584 766 ntTSL 323.66■■□□□ 1.384e-11■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 RHOC-216ENST00000484280 891 ntTSL 516.33■□□□□ 0.28e-12■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.652e-11■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.652e-11■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.582e-11■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.472e-11■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.352e-11■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 DIABLO-202ENST00000342392 1336 ntTSL 1 (best)16.59■□□□□ 0.252e-11■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 RPS18-236ENST00000490191 996 ntTSL 219.84■□□□□ 0.773e-71■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 PIN1-205ENST00000586352 755 ntTSL 318.61■□□□□ 0.577e-8■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.348e-7■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 TXNL1-206ENST00000587807 2035 ntTSL 217.33■□□□□ 0.378e-7■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 TXNL1-201ENST00000217515 6894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.48e-7■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 TXNL1-210ENST00000589931 466 ntTSL 35.2□□□□□ -1.588e-7■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.66e-19■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 FTH1-206ENST00000530019 550 ntTSL 418.81■□□□□ 0.66e-19■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.66e-19■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 FTH1-211ENST00000534719 788 ntTSL 1 (best)16.6■□□□□ 0.256e-19■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 FTH1-210ENST00000534180 983 ntTSL 216.28■□□□□ 0.26e-19■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.036e-19■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 FTH1-208ENST00000532829 912 ntTSL 214.72□□□□□ -0.056e-19■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 FTH1-209ENST00000533138 885 ntTSL 513.72□□□□□ -0.216e-19■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 FTH1-203ENST00000529191 530 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.256e-19■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 FTH1-212ENST00000620041 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.736e-19■■■■□ 19.7
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PABPC4Q13310 MRPS33-201ENST00000324787 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.73e-6■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 MRPS33-202ENST00000393008 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.773e-6■■■■□ 19.7
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PABPC4Q13310 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.483e-6■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 MRPS33-206ENST00000484502 466 ntTSL 35.1□□□□□ -1.593e-6■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 RPL11-201ENST00000374550 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.693e-42■■■■□ 19.7
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PABPC4Q13310 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.244e-8■■■■□ 19.7
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PABPC4Q13310 LSM4-206ENST00000600289 1113 ntTSL 219.33■□□□□ 0.682e-14■■■■□ 19.6
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PABPC4Q13310 NFE4-201ENST00000420058 1072 ntTSL 1 (best)17.57■□□□□ 0.43e-10■■■■□ 19.6
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PABPC4Q13310 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.897e-10■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.097e-10■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.795e-7■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.55e-7■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 BCAS2-202ENST00000485021 891 ntTSL 217.97■□□□□ 0.475e-7■■■■□ 19.6
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PABPC4Q13310 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.35e-8■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.185e-8■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.645e-8■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.545e-8■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 OTUB1-201ENST00000301453 2493 ntTSL 217.88■□□□□ 0.455e-8■■■■□ 19.6
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PABPC4Q13310 BTK-210ENST00000621635 2767 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.912e-6■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 BTK-201ENST00000308731 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -12e-6■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.222e-6■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 FDFT1-207ENST00000525607 1773 ntTSL 221.93■■□□□ 1.16e-20■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 FDFT1-218ENST00000530664 1761 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.056e-20■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 ZNRF1-207ENST00000568351 964 ntTSL 317.41■□□□□ 0.381e-6■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.183e-7■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 CLPX-204ENST00000559152 2228 ntTSL 1 (best)12.47□□□□□ -0.413e-7■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 GPX4-205ENST00000587932 274 ntTSL 234.01■■■■□ 3.039e-13■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.971e-6■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.732e-6■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.452e-6■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.392e-6■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 STK16-212ENST00000496443 2094 ntTSL 222.42■■□□□ 1.188e-12■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.182e-6■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.178e-12■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.072e-6■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.073e-6■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 SPHK1-209ENST00000591762 2502 ntTSL 219.47■□□□□ 0.712e-6■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 PSME2-212ENST00000560370 620 ntTSL 318.73■□□□□ 0.594e-9■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.48e-12■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.288e-12■■■■□ 19.6
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