Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms