Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms