Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ID3Q02535 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ID3Q02535 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID3Q02535 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID3Q02535 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID3Q02535 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID3Q02535 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ID3Q02535 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID3Q02535 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID3Q02535 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID3Q02535 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ID3Q02535 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID3Q02535 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID3Q02535 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID3Q02535 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID3Q02535 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID3Q02535 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID3Q02535 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ID3Q02535 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID3Q02535 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID3Q02535 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID3Q02535 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID3Q02535 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID3Q02535 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ID3Q02535 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID3Q02535 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID3Q02535 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID3Q02535 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID3Q02535 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID3Q02535 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID3Q02535 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID3Q02535 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID3Q02535 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID3Q02535 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID3Q02535 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID3Q02535 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID3Q02535 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID3Q02535 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID3Q02535 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID3Q02535 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID3Q02535 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID3Q02535 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID3Q02535 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID3Q02535 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID3Q02535 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID3Q02535 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID3Q02535 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ID3Q02535 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms