Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms