Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKL1Q00532 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms