Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms