Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11AP62491 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms