Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms