Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP6P59044 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms